Кафедра информатики была основана в 1985 году на базе кафедры алгебры и геометрии под названием «Вычислительная математика». В 1986 году она была переименована в кафедру «Информатика и вычислительная техника».
С 1993 года она называлась «Информатика», а с 1996 года, в связи с открытием новых специальностей на физико-математическом факультете, была преобразована в кафедру «Прикладная математика и информатика». В 2002 году кафедра вновь получила название «Информатика».
В 2020 году после разделения кафедры «Информатика» была создана кафедра «Прикладная информатика и информационная безопасность».
Руководство: Со дня основания кафедру возглавляли: к.ф.-м.н., доцент Ободоева Г.С. (2020-2021). С 2021 года по настоящее время кафедрой руководит к.ф.-м.н., доцент У.З. Эркебаев.
Реализация подготовки компетентных специалистов путем развития направлений «Прикладная информатика» и «Информационная безопасность».
На сегодняшний день на кафедре трудятся: 2 доктора ф.-м. наук, профессора; 9 доцентов; 6 старших преподавателей; 14 преподавателей и 1 старший лаборант. Качественный показатель профессорско-преподавательского состава кафедры составляет 35%.
Преподаватели кафедры обучают студентов бакалавриата и магистратуры по направлениям «Прикладная информатика» и «Прикладная математика и информатика» на высоком научно-методическом уровне, внося вклад в подготовку высококвалифицированных кадров.
Преподаватели активно участвуют в организации мероприятий на уровне факультета, университета и города. Культурно-воспитательная работа проводится согласно плану ответственными сотрудниками кафедры.
Результаты исследований обсуждаются на научных семинарах для студентов и аспирантов, представляются на международных конференциях. На сегодняшний день опубликовано более 330 научных статей и 10 монографий.